Software für die Identifikation von Mikroorganismen
Neu! Testen Sie jetzt die tree Universitäts-Version einen Monat lang: hier gehts zum Downloadbereich!
tree ist ein Software-Paket, das die schnelle und zuverlässige Identifizierung von kultivierten und nicht kultivierten Mikroorganismen ermöglicht. tree basiert auf der erfolgreichen Methode der vergleichenden Analyse ribosomaler RNA-Sequenzen. Das Basispaket umfasst die für die Identifikation von Bakterien und Pilzen notwendigen 16S rDNA und 18S rDNA-Datenbanken. Optional sind weitere Datenbanken erhältlich. Regelmäßige Updates der tree-Datenbanken durch nadicom garantieren die fortdauernde Aktualität der Referenzen und eine Identifizierung auf höchstem Niveau. nadicom garantiert einen umfassenden Service zu tree. Dieser umfasst eine Einweisung in die Software sowie die Bereitschaft auch umfangreiche Phylogenetik-Schulungen durch das nadicom-Personal durchzuführen. tree steht für eine neue Generation effizienter und zukunftsweisender phylogenetischer Software.
Hier die tree-Broschüre als PDF-Download.
tree beinhaltet folgende Features:
- Einfacher verständlicher Aufbau der Software für ein effizientes Arbeiten
- Alle Arbeitsschritte von den Rohdaten zum aufgearbeiteten Baum in einem Programm
- Optimale Korrekturmöglichkeiten der Rohdaten im Kontext der bestehenden Datenbank (Aufarbeitung von Elektropherogrammen)
- Zuverlässige automatische Eingliederung der Sequenzen in den Kontext des bestehenden Datenbank-Alignments
- Stets reproduzierbare Berechnung phylogenetischer Stammbäume
- Datenverwaltung für die langfristige Archivierung eigener Sequenzen mit integrierter Datenbankfunktionalität
- Erstellung eigener DNA-basierter Datenbanken
- Export aller Ergebnisse und Daten in Standardformate
- Generierung von Daten entsprechend der GMP-Richtlinien und der Vorgaben industrieller Kunden
- tree ist Windows®-basierend und zeichnet sich durch seine intuitive Benutzerführung aus.
tree - Universitäts-Version
Die Universitäts-Version kennzeichnet sich durch größtmögliche Entscheidungsfreiheit des Anwenders. So wurden hier Beschränkungen aufgehoben und gegen eine größere Eigenverantwortung des akademischen Nutzers getauscht.
Darüber hinaus ist die Generierung eigener Datenbanken jeglicher Spezies möglich.
Das Paket enthält kleinere 16S/18S Datenbanken zu einem angepassten Budget.